木托盘的结构直接影响木托盘的使用效率，适合的结构能够充分发挥搬运、存储率作业的特点。
1、木托盘作为地台板使用，即木托盘装在货物以后不再移动，只是祈祷防潮防水的作用，可选择结构简单、成本较低的木托盘。如简易的木托盘或简易的塑木料托盘，但是使用时应该注意木托盘的静载量。
2、用于运输、搬运、装卸的木托盘要选择强度高、动载大的托盘。这类木托盘由于要反复使用并且要配合叉车使用，因此对木托盘的强度要求较高，要求木托盘的结构是田字型或者是川字型。
3、根据木托盘 装在货物以后是否要堆垛来选择单面木托盘还是双面木托盘。单面木托盘由于只是一个承载面，不适合用于堆垛，否则容易造成下层货物的损坏。装载货物后需要堆垛的要尽选择双面木托盘。
4、如果木托盘是用在立体库的货架上，要考虑木托盘的结构是否适合码放在货架上。通常由于只能从两个方向从货架上插取货物，因此用于货架上的木托盘应该尽可能选用四面进叉的木托盘，这样便于叉车叉取货物，提高工作效率。这样的木托盘一般选择田字型的结构。
木木托盘承重的选择
动载指叉车一次所能允许举起的重量：静载指在码垛中，下面的木托盘所能承受的重量;架空载荷指在货架上的载重量。如果是在货架上使用，一定要注意动载与就架空载荷的区别，挠曲度国家标准为30mm，但这个标准明显偏宽。我们简易在货架上使用时挠曲度以不超过20mm 为适宜，如果是自动立体库，这个要求还要严格一些。
其他需要考虑的因素
冷库中使用时，塑料托盘会变脆：过多加入再生料的木托盘使用寿命降低。
标准化托盘尺寸
采用统一的标准化托盘尺寸，可以确保货物在不同运输环节中的无缝对接。物流企业应当采用国家或国际标准的托盘尺寸，如1200mm x 1000mm或1100mm x 1100mm，这样可以减少货物在装卸过程中的转换次数，提高装卸效率。
托盘共享系统
建立托盘共享系统，可以减少托盘的闲置和重复购买，降低物流成本。物流企业可以通过合作，建立一个托盘共享网络，实现托盘的循环使用。这样，企业可以根据实际需求租借或归还托盘，提高托盘的使用效率。
货物单元化
使用托盘将货物单元化，可以提高货物的稳定性和性，减少运输过程中的损坏。物流企业应当在货物打包时，将货物合理地堆放在托盘上，使用缠绕膜或捆扎带固定，确保货物在运输过程中的稳定。