商业承兑汇票和银行承兑汇票的区别在于，承兑人不同，决定了商业承兑汇票是商业信用，银行承兑汇票是银行信用。银行承兑汇票一般由银行签发并承兑，而商业承兑汇票可以不通过银行签发并背书转让，但在信用等级和流通性上低于银行承兑汇票，在银行办理贴现的难度较银行承兑汇票高。
票据贴现是应收和应付票据的贴现。企业筹措资金的一种方式。企业在应收票据到期之前，将票据背书后上交银行贴现，银行将票据的到期价值，扣除按照贴现利率计算的从贴现日至到期日的利息 (贴现折价)后的余款付与企业，称为应收票据贴现。
商业承兑汇票的贴现是以企业信用为基础的融资，如果承兑企业的资信非常好，相对较容易取得贴现融资。对中小企业来说以票据贴现方式融资，手续简单、融资成本较低。银行承兑汇票贴现以银行的信用为基础的融资，是客户较为容易取得的融资方式，操作灵活、简便。贴现利率市场化程度高，资金成本较低，有助于中小企业降低财务费用。
票据贴现利息一般由贴现申请人(贸易的卖方)完全承担，而协议付息票据在贴现利息的承担上有相当的灵活性，既可以是卖方又可以是买方，也可以双方共同承担。与一般的票据相比，协议付息票据中贸易双方可以根据谈判力量以及各自的财务情况决定贴现利息的承担主体以及分担比例，从而达成双方为满意的销售条款。