履约保函和预付款保函现在使用的非常广泛，政府采招项目，大型房地产公司的招标项目，铁路物资招标项目、国家电网的招标项目等都会明确要求必须提供此类保函，以保证项目的规范性。那么履约保函与预付款保函这两者之间有什么样的区别呢？
1、履约保函广义上包括了履约保函、预付款保函、质量保修保函等，预付款保函其实是一种特殊形式的履约保函。 有时候一个项目中只要求提供一个履约保函。而不需要预付款保函，因为有的项目就没有预付款，有时候会要求履约、预付款保函同时开具，具体情况须当以实际项目而定。是为了保证中标单位如约履行工程合同的内容。
2、预付款保函是保证在甲方支付了预付款之后能收到合同约定的效果，也即在甲方支付了预付款之后如乙方没有履行合同，银行则将预付款保函的相应押金交还给甲方作为损失补偿。
3、预付款的保函和履约保函一样需要付押金，但是预付款保函却不像履约保函那样一定要到工程全部建设结束，合同内容履行完毕之后才退还给你。通常是约定保证预付款用在合同上就可以退还了。只是在工程建设前期冻结在银行，后面就解冻了。
开立银行的责承诺：
在保函中，出具保函的银行承诺的内容是重要的，该银行的承诺必须是"无条件的"和"不可撤消的"。"无条件的"即意味着当买方仅凭保函书面称卖方未履行其交货义务，要求出具保函银行按保函金额付款时，买方无需提供其他任何证明，也不管实际原因如何，该银行必须立即无条件地支付保函金额。“不可撤消的"是指保函在开立后，在规定的有效期内是不能撤消的。
金额
一般情况保函的金额就是预付款的金额。但对预付款的付款时间和合同交货时间较长而且金额较大的合同，我们在商务谈判中可要求保函的金额为预付款金额加上从预付款支付到买方索偿这段时间的利息，利率买卖双方事先商定。除保函另有声明外，保函担保金额不因合同被部分履行而减少。
有效期
从理论上讲，保函的目的是为了防止卖方不按合同规定交货而买方损失预付款，当卖方履行了交货义务后，保函的作用也就完成了。所以绝大部分保函的有效期从开立日始到装船日但不超过合同迟装船期，原则上说是对的。但笔者在实际业务中发现，这样的条款存在漏洞：a.保函实际失效时间先于卖方履行交货义务的后期限。对失效地点在中国的保函，当保函失效时，由于时差关系，对于美国卖方而言，还有十几小时才到迟装船期。
b.买方无时间办理索偿手续。对失效地点在卖方所在地的保函，当买方获知卖方未能在迟装船期内履行交货义务，此时保函时效也已到，由于地理位置的差异，买方已没有时间办理有关索偿手续。所以我们应要求保函有效期至合同迟装船期后几个工作日较妥。我们之所以强调是"工作日"主要考虑遇到节假日的情况。
预付款保函的种类
保函种类主要有以下五种：
一种是预付款保函、有称还款担保是指向受益人保证，如申请人没有按时预付款，则银行负责返还担保函规定的金额。预付担保的金额不超过承包人收到工程预付金额。
第二种是投标保函、是向受益人作出保证，在申请人报价的有效时间内，投标人不可车标、改标、更改原报价条件，应遵守其诺言，并且一旦中标后，要在规定的时间内和招标人签订合同，如果招标人违约，银行将子啊担保额度的范围内向招标人支付金额，投标人报价总额的1%-5%不等。
第三种是履约保函、是指应劳务方和申请人的要求，向工程的受益人所作出的一种保证承诺。
第四种是质量保函、是指申请人的请求，向受益人保证，在工程质量不符合合同规定，申请人又不能维修时，由农业银行按担保函规定金额赔付工程业主。该款项通常为合同价款的5%-10%。
第五种是临时进口设备再出口保函、按国际工程承包惯例，凡承包商为施工而临时进口的机械设备可免关税，但完工以后，用于施工临时进口设备必须如数再运出工程所在国。
预付款保函扣除
当申请人未能向受益人履行合约，则银行将代替申请人向受益人支付预付款，同时，申请人在银行购买的此项服务终止，预付款保函失效。
预付款保函是合同乙方保证自己收入的一种手段，这种保障手段多出现在工程中，为了保障合同双方平等，若有条件，甲方都应该先申请办理预付款保函，目的是为了在项目结束时，如果自己没有能力完成和合同约定的条款，将由银行出面，将甲方事先支付的预付款付给乙方，保证乙方的权益不受损失。当银行履行完此项业务时，预付款保函扣除。