重要的是要有一套运行有效的生态过滤系统，其中包括机械过滤和生物过滤。通常的机械过滤只能去除固体污物，而溶于水中的还有大量的，如蛋白之类的有机物是无法滤清的，只有靠生物过滤系统才能完成。
鱼缸里面的水因为大量喂食、排析物和鱼身上的分秘物的产生，会有越来越多的有机物质积累，这些有机质废物会凝聚、附着在缸壁上，而大量的都悬浮在水中或沉于底砂上。由于水温高，有机物会加快腐败，导致混浊度增加，水质变坏，溶氧量明显降低，氨及硝酸盐大量增加，水会变得十分浑浊，鱼在这样的水中生活极易得病，甚到死亡。在鱼缸中建成一个生态过滤系统，进行有效的生态过滤，将有机质分解，就可以减少这些附着物的产生，不仅将水中的固体废物过滤清除，使水体变得十分清澈，水质稳定，还可以有效减少鱼病的发生。
市场有些劣质饵料，为增加卖相会加入色素，喂用时饵料中的色素溶入水里，就使水变为色，如出现此情况就应更换饵料才能沏底解决。
水草也是净化水体的好帮手，应该尽量多养水草，使整个水族缸变成一个小小的生态乐园，水体自然就变得十分清澈。
在缸中投放清道夫和食苔虾，它们能清除附着在缸壁上的污垢和藻类，使缸壁清晰。
刚买回来的热带鱼，不能立即放入已有鱼的鱼缸中。应将鱼和盛鱼的容器一起放入鱼缸约半小时，使前者和后者的水温一致，然后再将鱼放入鱼缸。鱼缸中的水温一般应保持在25℃左右。鱼缸中鱼的密度不宜过大。如果鱼缸中的水表面有一层灰白色的沉淀物，就应该换水。自来水和开水不能直接注入鱼缸，要将二者混合放凉，或者将自来水放置3～4 天后和开水混合，当其温度与鱼缸中的水温相接近时，方可注入鱼缸。鱼食是活虫，一次投食不宜过多，投两次即可。