斑点叉尾鮰体型较长，体前部宽于后部，头较小，吻稍尖，口亚端位，体表光滑无鳞，粘液丰富，侧线完全，皮肤上有明显的侧线孔。头部上下颌具有深灰色触须4对，其中鼻须1对，颌须1对，颐须2对，长短各异，以颌须为长，末端超过胸鳍基部，鼻须短。鳃孔较大，鳃膜不连于峡部，颐部有较明显而不规则的斑点，体重大于0.5公斤的个体斑点消失。具有脂鳍一个，尾鳍分叉较深，各鳍均为深灰色。体两侧背部淡灰色，腹部乳白色，幼鱼体两侧有明显而不规则的斑点，成鱼斑点逐步不明显或消失。
斑点叉尾鮰在江河、湖泊、水库和池塘中均能产卵于岩石突出物之下，或者淹没的树木、树桩、树根之下或河道的洞穴里。斑点叉尾鮰的雄鱼是典型的筑巢鱼类，在与雌鱼交尾后赶走雌鱼，并守护受精卵发育直至孵出鱼苗。通常斑点叉尾鮰产卵温度范围为21－29℃，适温度为26℃，水温超过30℃不利于受精卵的胚胎发育和鱼苗成活。在长江流域斑点叉尾鮰的繁殖季节为6－7月。体重（或年龄）较大的比体重（或年龄）较小的其产卵季节要早些。产卵时，每尾鱼通常以尾鳍包裹对方头部，雄鱼剧烈颤动鱼体并排出精液，与此同时，雌鱼开始产卵。卵受精后发粘，相互粘结而附于水池底部。据Clemens和Sneed(1957）报道，雄鱼护卵时位于卵块上方，不断摆动腹鳍，以达到对受精卵增氧的作用。
斑点叉尾鮰属底栖鱼类，主要栖息于湖泊、河流有砂砾、石块的底层，喜欢在阴暗的光线条件下集群摄食，有昼伏夜出的摄食习惯。水温4～5 ℃ 开始摄食，39 ℃ 时停食，生长温度为5 ～ 36 .5 ℃ ，适生长温度为18 ～30 ℃ 。溶氧3 毫克/升以上较好，低子0 . 8 毫克/升时出现浮头，0 . 34 毫克/升时窒息死亡。正常生长的pH 值为6 . 5 ～8 . 9 。池养条件下第1 年长至13 ～35 厘米，第2 年35 ～45 厘米，第3 年达45 ～57 厘米。